Expressed Sequence Tag

Expressed Sequence Tag, aussi appelé EST, est une séquence de nucléotides utilisée par les biologistes pour trouver des gènes dans une séquence ADN. Parce qu'il est assez facile de récupérer des brins ARNm des cellules (à l'exception de certaines), les biologistes récupèrent ces séquences et les convertissent en cDNA, qui est bien plus stable. Un mRNA est en effet nécessairement l'expression d'un gène du génome. Ce cDNA n'est pas une copie exacte de la séquence ADN qui a généré le RNA car le RNA ne garde pas les régions non codantes de l'ADN (introns).

Si le génome est correctement identifié, les gènes le composant ne le sont pas encore tous. Et certains gènes identifiés ont une fonction encore inconnue. En utilisant les EST, on cherche à identifier un gène par le chemin inverse, autrement dit qu'on prend la séquence d'ARN pour trouver la séquence d'ADN qui l'a créée. Cela va permettre de localiser le gène dans le génome, tout en n'ayant aucune information sur le gène lui-même.

Pour effectuer une recherche sur la séquence d'ADN originelle, on n'utilise qu'une partie de l'information contenue dans le cDNA, une centaine de nucléotides. Cette sous-séquence est prise en début ou en fin de séquence. Le début est assez bien conservé d'une espèce à l'autre ; aussi, pour identifier de manière unique le gène en cause, on a tendance à utiliser la fin de la séquence comme base de recherche.

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